Sporna pitanja zaštite pojedinih delova privrede zemalja potpisnica biće regulisana članom 23 B, na kome su naročito insistirale Srbija i BiH, a Bugarska i Rumunija će se nakon prijema u članstvo Evropske unije, 1. januara 2007, povući. Sporazum CEFTA 2006 zamenjuje postojeća 32 bilateralna sporazuma o slobodnoj trgovini među zemljama jugoistočne Evrope i osigurava formiranje jedinstvene zone slobodne trgovine u regionu sa 30 miliona stanovnika (sa Bugarskom i Rumunijom 55 miliona), odnosno potencijalnih kupaca. Kad profunkcioniše ovaj sporazum, svi proizvodi koji se prave na teritoriji regiona tretiraće se kao da su poreklom iz CEFTA, bez obzira na to iz koje se države izvoze.

Preduzeća u regionu moći će međusobno da sarađuju kroz korišćenje sirovina i finalnih proizvoda i da zajedničke proizvode bez carina i ograničenja plasiraju na evropsko tržište. Ovim sporazumom definisano je, naime, da 100 odsto industrijske robe i 90 odsto poljoprivrednih proizvoda koji se plasiraju u okviru regiona CEFTA, idu na nulti režim carine. Dakle, da se ne carine.